Начало формирования коллекций будущего исторического музея. Инициатором выступил Александр Серафимович Гациский, секретарь нижегородского статистического комитета, историк.
Начало работы Нижегородской губернской учёной архивной комиссии (НГУАК), председателем которой был избран А.С. Гасицкий. Заседания НГУАК проходили в Ивановской башне Нижегородского Кремля, в одном из помещений которой было организовано хранение предметов и памятников древностей, собранных членами НГУАК и пожертвованных частными лицами.
16 мая 1890 года музей, разместившийся в «Петровском домике» на Почайне, получил название «Петровский исторический музей» (протокол НГУАК от 16 марта 1890 г.). Обустройство его заняло более четырёх лет.
Для публики Петровский исторический музей был открыт 3 января 1905 г.
25 июня (7 июля по новому стилю) открыт Нижегородский городской художественный и исторический музей в Дмитриевской башне Нижегородского кремля.
Коллекция художественного отдела состояла из присланных в дар Академией Художеств и русскими художниками произведений. Коллекция исторического отдела была полностью перенесена из Петровского домика.
В связи с необходимостью ремонта Дмитриевской башни, музей перемещён в здание Дворянского собрания (ул. Большая Покровская).
Исторический отдел музея переведён в отремонтированную Дмитриевскую башню Нижегородского кремля, а художественный остался на Большой Покровской.
Реквизирована усадьба купца Сергея Михайловича Рукавишникова (1852–1914).
Главный дом усадьбы приспособлен под новый Народный Художественный музей. Согласно Отношению Исполнительного Комитета Нижегородского Совета рабочих, солдатских и крестьянских депутатов от 26 февраля 1918 г. № 1174 и 4175, художественный отдел был переведён в дом Рукавишниковых на Верхне-Волжской набережной.
К организации нового музея в бывшем родительском доме были привлечены сыновья купца Рукавишникова Иван (уже известный тогда поэт и писатель и Митрофан (осснователь династии скульпторов Рукавишниковых)
21 июля 1918 г. Нижегородский хедожественный музей был открыт.
Исторический отдел Нижегородского городского художественного и исторического музея из Дмитриевской башни кремля был переведён в особняк Варвары Михайловны Бурмистровой (1851–1932), урождённой Рукавишниковой, и назван Нижегородский исторический музей (по распоряжению Нижегородского Губисполкома от 1 октября 1918 г.) В настоящее время в этом здании находится Литературный музей А.М. Горького (ул. Минина, 26).
Художественный музей переведён в бывшую усадьбу Д.В. Сироткина на Верхне-Волжской набережной и открыт для публики 5 марта 1924 г.
Один из авторских эскизов дома Д.В. Сироткина на Верхне-Волжской набережной. Иллюстрация из журнала ''Нижегородский музей'' № 13 (2007).
Нижегородский исторический музей в связи с реорганизацией переведен в главный дом Усадьбы Рукавишниковых на Верхне-Волжской набережной и назван Государственный историко-бытовой музей Нижегородского края. Был открыт для публики 29 июня 1924 г.
В октябре 1924 г. исторический музей объединён с художественным под названием Нижегородский государственный объединённый музей с отделениями историческим и художественным.
Исторический отдел занимал три этажа дома Рукавишниковых, а художественный — главный дом и флигель бывшей усадьбы Д.В. Сироткина.
Коллекция Шереметевых в бальном зале дома Рукавишниковых, эвакуированная в 1923 г. из шереметевского замка в с. Юрино.
25 июня (7 июля по новому стилю) открыт Нижегородский городской художественный и исторический музей в Дмитриевской башне Нижегородского кремля.
Коллекция художественного отдела состояла из присланных в дар Академией Художеств и русскими художниками произведений. Коллекция исторического отдела была полностью перенесена из Петровского домика.
Художественный отдел с его коллекциями выделен из состава Краевого музея для создания самостоятельного Художественного музея (Приказ Горьковского Краевого отдела народного образования от 14 октября 1934 г. № 201).
Ныне — Нижегородский государственный художественный музей (отдел западноевропейского искусства 15 — начала 20 веков и экспозиция одной картины — «Воззвание Минина» К.Е. Маковского; Верхне Волжская набережная, 3).
На основании Указания Комитета по делам музеев Наркомпроса РСФСР музей переименован в «Горьковский областной государственный краеведческий музей». В музее складывается новая структура, состоящая из трёх отделов: природы, истории и социалистического строительства.
Горьковский городской комитет обороны в своём постановлении от 28 октября 1941 года предложил в срочном порядке, за 6–7 дней, освободить здание Областного Краеведческого музея и перевезти его коллекции в село Тонкино Горьковской области.
В феврале 1943 г., когда положение на фронте стабилизировалось, Горьковским городским комитетом обороны было принято решение о возвращении музея из эвакуации.
20 апреля 1943 г. музей вернулся в стены дома на Верхне-Волжской набережной.
Создан Дом-музей сестёр Невзоровых (ул. Горького, 127), который знакомил с особенностями жизни и быта разночинной нижегородской интеллигенции на рубеже 19–20 вв.
С 1993 года был переименован в «Музей нижегородской интеллигенции».
Открыт для посетителей Музей архитектуры и быта народов Нижегородского Поволжья. Известен многим как музей под открытым небом на Щёлковском хуторе.
Выведен из состава НГИАМЗ в 2013г.
В состав НГИАМЗ включён Нижегородский острог (пл. Свободы, 2) - тюремный комплекс начала XIX в.
Выведен из состава музея-заповедника в 2013г.
Закрыто на реставрацию главное здание музея — главный дом усадьбы купца С.М. Рукавишникова.
7 сентября — открытие Главного здания НГИАМЗ Усадьбы Рукавишниковых после реставрации.
В 2012 году была восстановлена Зачатская башня кремля и примыкающие к ней участки стен, обрушившиеся 200 лет назад.
Тем самым кольцо крепостных стен снова замкнулось.
1 августа 2013 г. открыт Музей Русского Патриаршества в городе Арзамасе — совместный проект НГИАМЗ и Нижегородской митрополии Русской Православной церкви.
30 декабря НГИАМЗ передано в оперативное управление здание по ул. Провиантская, д. 5 - «Дом Балакирева».
В 2014 году разработаны предложения по его музеефикации.
24 мая НГИАМЗ передано в оперативное управление здание по ул. Дальней, д. 15 – «Дом купца В.И. Смирнова».
В состав НГИАМЗ вошёл Технический музей, представляющий коллекцию старинной техники и инструментов В.В. Хуртина.
4 ноября — открытие филиала НГИАМЗ Мультимедийного исторического парка «Россия — моя история» в Главном ярмарочном доме.
