Ученый совет Нижегородского музея-заповедника является постоянно действующим, общественным, коллегиальным, совещательным, научно-консультационным и экспертным органом. Он исторически помогает музею решать самый широкий спектр вопросов научно-исследовательской, экспозиционной и просветительской деятельности, обеспечивает поддержку новых проектов и инновационных практик. Члены Ученого совета принимают участие в различных мероприятиях музея – конференциях, лекториях и презентациях выставок и экспозиций.
В состав Ученого совета традиционно входят преподаватели и исследователи из вузов и научных центров нашего региона: ННГУ им. Н.И. Лобачевского, НГПУ им. К. Минина, ННГАСУ, НГТУ им. Р.Е. Алексеева, Высшей школы экономики, Волжского государственного университета водного транспорта, а также ведущие нижегородские специалисты в области музейного, архивного и библиотечного дела. Кроме того, в составе совета работают представители региональных властей, Института археологии РАН, эксперты по проведению государственной историко-культурной экспертизы Министерства культуры Российской Федерации.